Uszkodzenia logiczne, które dotyczą zniszczeń dokonanych na sprawnym technicznie dysku twardym. Są to uszkodzenia wpisów partycji, nadpisanie struktury plików i katalogów, format partycji.

Mogą być one spowodowane działaniem wirusów, aczkolwiek w dzisiejszych czasach zdarza się to coraz rzadziej. Nowoczesne wirusy zamiast niszczyć komputerowe dane starają się raczej dokonać ich przejęcia. Większość dzisiejszych wirusów nastawionych jest na kradzież danych użytkowników lub przejęcie komputera i wykorzystania jego mocy obliczeniowej i dostępu do internetu dla celów twórcy wirusów.

Ogromna większość uszkodzeń logicznych jest spowodowana przez błąd systemu operacyjnego, aplikacji lub błąd człowieka. Typowe przykłady to: zawieszenie programu, błędne odwołanie do pamięci, format dysku, nadpisanie danych przez instalację nowego systemu operacyjnego (lub oprogramowania), czy uszkodzenie danych poprzez dynamiczną zmianę rozmiaru partycji, na której znajdują się cenne dane. Niestety nie w każdym przypadku możliwe jest odzyskanie danych. Jest to uzależnione indywidualnie od sposobu uszkodzenia. W przypadkach uszkodzeń logicznych dysku średnia skuteczność odtwarzania danych wynosi około 70%.